مكتب ضمان الجودة بكلية العلوم الطبية والتطبيقية هو مكتب يعنى بتطبيق معايير الجودة والاعتماد الأكاديمي، ومتابعة الأداء الأكاديمي، والذي من خلاله تُنفَّذ عمليات المراجعة الداخلية وتقييم الأداء لضمان الجودة في مختلف التنظيمات الإدارية، التعليمية والبحثية والخدمية، وما يرتبط بها من عناصر مؤثرة، بهدف تحسين مستوى الأداء بالكلية.